為加強本校高教深耕計畫執行績效與完善制度，本校於110年6月29日高教深耕計畫第3次工作小組會議修正後通過「國立暨南國際大學高等教育深耕計畫管考實施要點」草案，並提送第558次行政會議臨時動議照案通過。
本要點共有七點條文，重點如下：
一、 揭示本要點立法目的。
二、 說明管考單位執掌及聯絡窗口工作任務。
三、 詳述績效管考機制層級與具體做法。
四、 敘明計畫執行成果公開方式與時程。
五、 說明管考結果將為次年度經費分配及人員考核之參考。
六、 說明專任助理薪資依據及應遵守事項。
七、 說明法規訂定程序與適用期限。
要點包括校內與校外管考機制：
- 校內管考機制
- 各分項計畫應兩週定期召開管考會議，落實各分項之計畫目標、進度及追蹤經費執行情形。
- 教發中心每個月定期召開管考會議，會議由校長或指定之主管擔任主席，請各分項計畫主持人提報計畫及經費執行進度。
- 每年提案校級考核會議品保，本計畫依據本校「校務發展執行成效考核作業要點」，每年由教發中心提案至校級考核會議報告執行情形 。
- 校外管考機制
將本計畫執行狀況與成果提交本校校務諮詢會議，由校外委員進行審查並給予改善建議。
經通過後，本校已於10月28日、11月25日、12月28日召開三次一層管考會議，並展開各子計畫個別召集四次二層管考會議，以推動各項高教深耕計畫重要業務，落實管考及追蹤計畫執行進度。
